【展商风向】艾吉泰康联合创始人屈武斌发表新冠病毒引物设计新著作！

艾吉泰康联合创始人屈武斌发表新冠病毒引物设计新著作！

艾吉泰康联合创始人屈武斌以第一作者兼通讯作者的身份在Methods in Molecular Biology系列书籍《PCR Primer Design（第三版）》发表了题为“PCR Primer Design for the Rapidly Evolving SARS-CoV-2 Genome”的文章，该书籍已于2021年11月14日正式上市。这是屈武斌继在2015年《PCR Primer Design（第二版）》发表的题为“Selecting Specific PCR Primers with MFEprimer”后的又一力作。

PCR技术

PCR技术是许多常用新冠病毒检测的技术基础，例如通过实时定量PCR进行快速检测，通过多重PCR进行全长测序和变异追踪。新冠病毒快速进化带来的新发变异，为以PCR为基础技术的检测方法带来了风险。关键原因是新发变异如果位于引物结合位点上，则极大可能导致PCR扩增失败。为了适应新冠病毒的快速进化，保证检测的可靠性。屈武斌在该文章中，以新冠病毒为例，提出了一套针对快速突变物种的引物设计方案：

通过样本基因组序列与参考基因组进行比对分析（传统二代分析思路），来识别SNP和InDel；

设计避开突变位点的引物；

使用每日更新的新冠病毒数据库来检查引物的覆盖率；

如果在引物结合位点发现了新的突变，需要及时重新设计引物。

注意：这套引物设计方案，适用于快速进化的物种，但这种变异占比需要局限在一定的比例，该比例和分析变异的分析流程相关。

文章信息

Qu W., Li J., Cai H., Zhao D. (2022) PCR Primer Design for the Rapidly Evolving SARS-CoV-2 Genome. In: Basu C. (eds) PCR Primer Design. Methods in Molecular Biology, vol 2392. Humana, New York, NY. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1799-1_14

 Qu W., Zhang C. (2015) Selecting Specific PCR Primers with MFEprimer. In: Basu C. (eds) PCR Primer Design. Methods in Molecular Biology, vol 1275. Humana Press, New York, NY. https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2365-6_15

作者信息

艾吉泰康联合创始人屈武斌为国际知名引物和探针设计专家，长期致力于寡核苷酸分子杂交特性的理论建模，PCR 引物及探针特异性与敏感性的分析与预测。

曾主持国家自然科学基金项目《多重 PCR体系的计算机仿真》，发表了多篇该领域内的相关 SCI 论文，影响因子累计超过50，领衔发表了高通量引物设计专著《PCR Primer Design》（第二版、第三版），公开发表的PCR引物设计与评估软件MFEprimer已在全球几百家机构中广泛使用。

关于艾吉泰康

艾吉泰康是一家专注于靶基因“读”和“写”技术解决方案开发与供应的中国高新技术企业，拥有具备自主核心知识产权的NGS探针杂交、多重PCR、高通量DNA合成三大底层技术平台。艾吉泰康已通过ISO 13485和ISO 9001等多项合规化生产质量管理体系认证，配套超2000㎡的GMP生产车间和检验实验室，为医疗健康、农业、微生物、学术研究等领域提供基因捕获产品的定制开发、NGS IVD产品的CDMO服务、靶向测序实验室解决方案供应、NGS测序速检服务及大规模DNA合成服务。

企业使命

为生命而精准设计

企业目标

做中国质造的基因捕获

企业文化

精益严谨，思行创新

企业价值观

诚信、高效、包容、担当

艾吉泰康的新冠病毒解决方案

艾吉泰康现有针对杂交捕获和多重PCR两套不同的新冠病毒全长检测解决方案，可进行病毒序列变异分析，覆盖所有突变株种类，适用于新冠全长测序、突变检测、病毒溯源等多个领域。相关试剂盒已经获得欧盟IVDD CE认证，并获得了由荷兰CIBG当局签发的体外诊断试剂注册许可，获得欧盟准入资格。

来源：艾吉泰康官方网站

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